Архипова, О.В. and Трошина, О.Ю. and Микулинская, Г.В. (2017) ПРОСТРАНСТВЕННАЯ МОДЕЛЬ АНАЭРОБНОЙ МЕТАКРИЛАТРЕДУКТАЗНОЙ СИСТЕМЫ. Вестник ТвГУ. Серия: Биология и экология (2). pp. 306-323. ISSN 1995-0160
![[img]](http://eprints.tversu.ru/style/images/fileicons/application_pdf.png) |
PDF
- Published Version
1MB |
Abstract
Компьютерное моделирование пространственной структуры метакрилатредуктазы (Mrd) и цитохрома с (Mcc) метакрилатной редокс системы Geobacter sulfurreducens AM-1 выявило высокое структурное сходство с растворимыми фумаратредуктазами Shewanella. Mrd и по последовательности, и структурно повторяет два С-концевых каталитических домена этих фумаратредуктаз – FAD-связывающий и домен-«зажим». Mcc сходен с малым N-концевым гемсодержащим доменом периплазматических фумаратредуктаз Shewanella. Высказывается предположение о пространственном взаимодействии консервативных аминокислот Mrd, участвующих в катализе и связывании субстрата
Abstract (en)
The high structural similarities of methacrylate reductase (Mrd) and cytochrome c (Mcc) (of the methacrylate redox system) from Geobacter sulfurreducens AM-1 with the soluble fumarate reductases of Shewanella were revealed by the computer modelling. Mrd repeates two C-terminal catalytic domains of these fumarate reductases – FAD-binding and clamp domains – both sequence and structure. Mcc is similar to small N-terminal heme-containing domain of the periplasmic fumarate reductases of Shewanella. The assumption of spatial interaction of the conservative amino acids from Mrd, involved in catalysis and substrate binding, is discussed
| Item Type: | Article |
|---|---|
| Additional Information: | АРХИПОВА Оксана Викторовна – кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории адаптации микроорганизмов, ФАНО Федеральное государственное бюджетное учреждение науки ИБФМ РАН, ТРОШИНА Ольга Юрьевна – кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории анаэробных микроорганизмов, ФАНО Федеральное государственное бюджетное учреждение науки ИБФМ РАН, МИКУЛИНСКАЯ Галина Викторовна – кандидат биологических наук, научный сотрудник группы молекулярной биотехнологии, ФАНО Федеральное государственное бюджетное учреждение науки РАН |
| Uncontrolled Keywords: | метакрилатредуктаза (Mrd), цитохром с (Mcc), флавоцитохромы с, периплазматические фумаратредуктазы, Geobacter sulfurreducens AM-1, Shewanella |
| Keywords (en): | methacryalate reductase (Mrd), cytochrome c (Mcc), flavocytochromes c, periplasmic fumarate reductase, Geobacter sulfurreducens AM-1, Shewanella |
| Subjects: | 5 Математика. Естественные науки > 57 Биологические науки > 577 Материальные основы жизни. Биохимия. Молекулярная биология. Биофизика > 577.1 Химические основы жизни. Биохимия и биоорганическая химия. Общие вопросы > 577.15 Ферменты. Катализаторы биохимических реакций. Энзимология |
| Divisions: | > Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, филиал, г. Пущино > Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина РАН, Пущино |
| ID Code: | 7761 |
| Deposited By: | С.Б. Федорова |
| Deposited On: | 12 Jul 2018 08:11 |
| Last Modified: | 12 Jul 2018 08:11 |
Repository Staff Only: item control page
