ПРОСТРАНСТВЕННАЯ МОДЕЛЬ АНАЭРОБНОЙ МЕТАКРИЛАТРЕДУКТАЗНОЙ СИСТЕМЫ

Архипова, О.В. и Трошина, О.Ю. и Микулинская, Г.В. (2017) ПРОСТРАНСТВЕННАЯ МОДЕЛЬ АНАЭРОБНОЙ МЕТАКРИЛАТРЕДУКТАЗНОЙ СИСТЕМЫ. Вестник ТвГУ. Серия: Биология и экология (2). С. 306-323. ISSN 1995-0160

[thumbnail of elibrary_30626517_47447945 306-323.pdf]

PDF - Опубликованная версия
1MB

Абстракт

Компьютерное моделирование пространственной структуры метакрилатредуктазы (Mrd) и цитохрома с (Mcc) метакрилатной редокс системы Geobacter sulfurreducens AM-1 выявило высокое структурное сходство с растворимыми фумаратредуктазами Shewanella. Mrd и по последовательности, и структурно повторяет два С-концевых каталитических домена этих фумаратредуктаз – FAD-связывающий и домен-«зажим». Mcc сходен с малым N-концевым гемсодержащим доменом периплазматических фумаратредуктаз Shewanella. Высказывается предположение о пространственном взаимодействии консервативных аминокислот Mrd, участвующих в катализе и связывании субстрата

Абстракт (англ.)

The high structural similarities of methacrylate reductase (Mrd) and cytochrome c (Mcc) (of the methacrylate redox system) from Geobacter sulfurreducens AM-1 with the soluble fumarate reductases of Shewanella were revealed by the computer modelling. Mrd repeates two C-terminal catalytic domains of these fumarate reductases – FAD-binding and clamp domains – both sequence and structure. Mcc is similar to small N-terminal heme-containing domain of the periplasmic fumarate reductases of Shewanella. The assumption of spatial interaction of the conservative amino acids from Mrd, involved in catalysis and substrate binding, is discussed

Тип объекта:	Статья
Сведения об авторах:	АРХИПОВА Оксана Викторовна – кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории адаптации микроорганизмов, ФАНО Федеральное государственное бюджетное учреждение науки ИБФМ РАН, ТРОШИНА Ольга Юрьевна – кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории анаэробных микроорганизмов, ФАНО Федеральное государственное бюджетное учреждение науки ИБФМ РАН, МИКУЛИНСКАЯ Галина Викторовна – кандидат биологических наук, научный сотрудник группы молекулярной биотехнологии, ФАНО Федеральное государственное бюджетное учреждение науки РАН
Ключевые слова:	метакрилатредуктаза (Mrd), цитохром с (Mcc), флавоцитохромы с, периплазматические фумаратредуктазы, Geobacter sulfurreducens AM-1, Shewanella
Ключевые слова (англ.):	methacryalate reductase (Mrd), cytochrome c (Mcc), flavocytochromes c, periplasmic fumarate reductase, Geobacter sulfurreducens AM-1, Shewanella
Категории:	5 Математика. Естественные науки > 57 Биологические науки > 577 Материальные основы жизни. Биохимия. Молекулярная биология. Биофизика > 577.1 Химические основы жизни. Биохимия и биоорганическая химия. Общие вопросы > 577.15 Ферменты. Катализаторы биохимических реакций. Энзимология
Подразделения:	Институты, НИИ > Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, филиал, г. Пущино Институты, НИИ > Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина РАН, Пущино
ID Code:	7761
Deposited On:	12 Июл 2018 08:11
Последнее изменение:	12 Июл 2018 08:11

Repository Staff Only: item control page